Parameters in R plotting (function par() is used to define parameters in R plotting)
Choose the righ “type” in R plotting
- type= ”p “ Plot points in graphics
- type= ”l “ Plot lines in graphics
- type= ”b “ Plot points joined by lines
- type= ”o “ Plot overplotted points and lines
- type= ”h “ Plot histogram-like vertical lines
- type= ”s “ Plot stair steps
- type= ”n “ Does not produce any points or lines
a）符号和线条
- pch:制定绘制点是使用的符号，常见的0表示正方形，1表示圆圈，2表示三角形
- cex:制定符号大小，默认值为1，1.5表示放大1.5倍
- lty:指定线条类型，常见的1表示直线，2表示虚线
- lwd指定线条宽度
- type类型：
- 线型
- 只有点(空心点)
- 点(空心点)和线同时
- 点(实心点)和线同时
b）颜色
- col：要绘制的点和线的颜色，hsv()函数可以基于色相、饱和度、亮度来调色，rgb()函数可以基于红绿蓝三色值调色
- col.axis：坐标轴上刻度的颜色
- col.lab：坐标轴标签的颜色
- col.main：主标题的颜色
- col.sub：副标题的颜色
- fg：图形的前景色
- bg：图形的背景色
R中用来创建多个连续型颜色变量的函数：rainbow(n); heat.colors(n); terrain.colaors(); topo.colors(); cm.colors(). 另外最受欢迎的调色包RColorBrew, 其中最重要的函数就是brewer.pal(), 还有brewer.pal.info()可以输出所有颜色系，然后利用display.brewer.pal()函数可以输出颜色图形, eg:
library("RColorBrew")
n <- 10
mycolors <- brewer.pal(n, "Set1")
barplot(rep(1, n), col=mycolors)
c）文本字体属性
- font，值为整数，1=常规，2=粗体，3=斜体，4=粗斜体，5=符号字体
- font.axis 坐标轴刻度文字的字体
- fon.lab 坐标轴标签文字的字体
- font.main 主标题字体样式
- font.sub 副标题字体样式
- 字体的磅值，文本的最终大小为ps＊cex
d）图形尺寸与边界尺寸
- pin(n1, n2) 图形尺寸，n1表示宽度，n2表示高度
- mai(n1, n2, n3, n4) 边界大小，分别是上下左右，单位为英寸
- mar(n1, n2, n3, n4) 边界大小，分别是上下左右，单位为英分
e）添加文本、自定义坐标轴与图例
- title()函数添加标题和坐标轴标签。main表示主标题，sub表示副标题，xlab表示横坐标轴标签，ylab表示纵坐标轴标签，xlim和ylim表示坐标轴范围
- axis()函数自定义坐标轴. side：表示在图形的哪一边绘制坐标轴，1=下；2=左，3=上，4=右 at：表示需要绘制哪一个变量的坐标轴 labels：刻度线下面的文字标签 lty：线条类型 col：线条和刻度线颜色 las：0表示标签平行于坐标抽，2表示标签垂直于坐标轴
- abline(h=yvalues, v=xvalues)函数添加参考线
- legend(location, title, legend, …)函数添加图例
- text（location, “text to place”, pos,…) 文本标注
- 图形的组合：par(mfrow=c(n,m))或者使用layout(matrix)函数，更精细的绘图需要用par(fig())图形参数
